Imprejurimile Pusztaszer sunt foarte valoroase din punct de vedere natural, iar zonele de aici fac parte din zona de protecție a peisajului Pusztaszer. Cea mai proeminentă zonă este ,,Scaunul Inputit,, cunoscut sub numele de Lacul Donger, situat la granița Pusztaszer. Zona include, de asemenea, rețeaua Natura 2000 din Valea Tisei de Jos (HUKN10007), ca zonă de protecție specială pentru păsări (SPA) și zona Pusztaszer Ramsari, destinată protecției zonelor umede. Acest lac salin superficial se evaporă complet în timpul verii. Flora sa este unică, plantele de stepă nisipoasă din Kiskunság se amestecă cu speciile saline. Printre plante, semințele rare (Sternbergia colchiciflora) sunt protejate. Cea mai importantă valoare naturală a zonei este viața păsărilor, până acum au fost observate peste 220 de specii. Multe dintre speciile care trăiesc aici sunt specii extrem de protejate , rare, cum ar fi Fluierarul cu picioare roșii (Tringa totanus),Sitarul de mal (Limosa limosa), Prundăraș de sărătură (Charadrius alexandrinus), Ciocîntors (Recurvirostra avosetta) sau Piciorong (Himantopus himantopus). Există, de asemenea, specii de reptile protejate în zonă, cum ar fi Șarpele de casă (Natrix natrix) sau Broasca-țestoasă europeană de baltă (Emys orbicularis).
